转录辅助因子对不同类型的核心启动子具有选择性

2022-02-14 13:35:44 来源:

转录辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与组蛋白两者之间传递转录线索，是转录酪氨酸和转录的当前现像若无。虽然已推测某些COF比其他COF格外偏爱某些组蛋白功能性，但是完全相同COF对完全相同组蛋白推测出的内在特异性的程度尚不清楚。在一项最初研究者里面，来自奥地利莱比锡生若无里面心分子解剖学研究者所的研究者执法人员在黑腹果蝇S2细胞里面用到高通量组蛋白活性测来比对23个COF酪氨酸7.2万个候选当前组蛋白（core promoter， CP）的能力。相关研究者结果于2019年5月15日应用软件发表文章在Nature学术期刊上，论文标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些研究者执法人员观察到当前组蛋白的差异酪氨酸，这确实COF与特定功能性的当前组蛋白两者之间不存在着完全相同的恒定偏爱或者说“相容性（compatibilities）”。这些功能完全相同的当前组蛋白在TATA包、下游组蛋白电子元件（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等目前为止的氨基酸电子元件上差异性地富集，并在可抑制位点上推测出完全相同的线粒体功能性。值得注意的是，这些当前组蛋白功能性在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上不存在完全相同的相对丰度，这确实这些两组蛋白词句可能能够区分环己烷恒定因子而不是组蛋白和增强子功能性的顺式恒定电子元件。这些研究者执法人员推测在人细胞和另外两种果蝇细胞里面推测了完全相同COF-当前组蛋白相容性的不存在。为此，他们发现了分别偏爱TATA包和CpG火山岛组蛋白的COF。COF和当前组蛋白两者之间的完全相同相容性能够解释完全相同的增强子如何特异性地酪氨酸完全相同两组的DNA、相同DNA内的高性能组蛋白（alternative promoter）和相同组蛋白内的完全相同转录起始位点。综上所述，COF-当前组蛋白相容性可能是果蝇和人类等完全相同若无种里面完全相同转录程序的基础。原始来历：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]